3月27日至31日,第33屆亞太肝病研究協(xié)會(Asian Pacific Association for the Study of the Liver,APASL)年會在日本京都隆重召開。來自亞太地區(qū)的專家學(xué)者歡聚一堂,分享在肝病領(lǐng)域的各項(xiàng)研究進(jìn)展。北京佑安醫(yī)院任鋒教授團(tuán)隊的一項(xiàng)研究“CRISPR/Cas13a助力精準(zhǔn)便攜的丁型肝炎病毒RNA檢測”入選大會口頭報告,并獲得Travel Award獎項(xiàng)。
丁型肝炎病毒(HDV)感染加速了慢性乙型肝炎病毒感染(HBV)的進(jìn)展,給患者帶來了巨大的經(jīng)濟(jì)和健康負(fù)擔(dān)。目前,仍然缺乏準(zhǔn)確和便攜的HDV RNA的檢測方法。因此,旨在利用CRISPR-Cas13a技術(shù)建立一種方便、快速、高靈敏度和特異性的方法來檢測HDV RNA。
本研究首先從HDV數(shù)據(jù)庫中下載了基因組序列,進(jìn)行了多序列比對,并設(shè)計和篩選了CRISPR RNA(crRNA)、反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)和反轉(zhuǎn)錄重組酶輔助擴(kuò)增(RT-RAA)引物在保守序列區(qū)域結(jié)合。在使用熱激活處理合成質(zhì)粒和樣本后,分別建立了基于CRISPR-Cas13a結(jié)合RT-PCR和RT-RAA的熒光和側(cè)流條檢測。臨床血漿樣本通過基于CRISPR-Cas13a的檢測得到進(jìn)一步驗(yàn)證。
研究結(jié)果表明,對于合成的HDV RNA質(zhì)粒,基于RT-PCR-CRISPR的熒光檢測的靈敏度為1拷貝/μL,高于反轉(zhuǎn)錄定量實(shí)時PCR(RT-qPCR)(10拷貝/μL)和反轉(zhuǎn)錄飛沫數(shù)字PCR(RT-ddPCR)(10拷貝/μL);對于HDV RNA陽性樣本,基于RT-RAA-CRISPR的熒光和試紙條檢測的靈敏度為10 copies/μL,與RT-qPCR和RT-ddPCR一樣低,且檢測時間僅約85分鐘。此外,通過RT-qPCR、RT-ddPCR、RT-PCR-CRISPR熒光和RT-RAA-CRISPR試紙條方法檢測的抗HDV IgG陽性樣本的陽性率分別為66.7%(48/72)、76.4%(55/72)、81.9%(59/72)和72.2%(52/72)。
本研究開發(fā)了一種高靈敏度和特異性的RT-PCR-CRISPR檢測方法以及一種基于RT-RAA-CRISPR的便攜式簡易檢測方法,可作為一種監(jiān)測HDV感染的發(fā)生發(fā)展和評價治療效果的有效措施。
通過本次會議,任鋒教授科研團(tuán)隊充分展示了課題組的最新研究成果,并通過此次發(fā)言增加了與國內(nèi)外專家充分交流的機(jī)會。此外,通過此次盛會任鋒教授科研團(tuán)隊也了解了肝病的最新研究動向,分享了目前肝病領(lǐng)域最新研究成果,學(xué)習(xí)了肝病領(lǐng)域最先進(jìn)科研技術(shù)方法,這些都為該團(tuán)隊的科研發(fā)展起到了很好的指導(dǎo)作用。
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