隨著基因組學(xué)研究的深入, 人們逐漸從單純的遺傳多樣性研究轉(zhuǎn)向遺傳-環(huán)境關(guān)系研究。單細(xì)胞分析為現(xiàn)今分子生物學(xué)研究的熱點(diǎn), 通過(guò)對(duì)單細(xì)胞的遺傳基因座水平的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)可以更加準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)表型?;蚨糠治龅膫鹘y(tǒng)方法Q-PCR技術(shù)只能一次監(jiān)測(cè)1-3個(gè)基因;GeXP系統(tǒng)采用創(chuàng)新的XP-PCR技術(shù),在只有單個(gè)細(xì)胞的情況下配合Ampligrid擴(kuò)增系統(tǒng),能夠?qū)Χ嘀?/span>30重的基因進(jìn)行定量分析, 是基因定量分析技術(shù)領(lǐng)域的突破性進(jìn)展.北京市肝病研究所引進(jìn)了該套設(shè)備,歡迎合作。
一、系統(tǒng)主要特點(diǎn)如下:
1.通量高: GeXP遺傳分析系統(tǒng)可以在每個(gè)反應(yīng)中分析多達(dá)30個(gè)基因; 可以對(duì)數(shù)萬(wàn)個(gè)樣品的數(shù)十甚至數(shù)百個(gè)基因位點(diǎn)進(jìn)行定量分析,這一能力是業(yè)界的任何其它方法所無(wú)法比擬的。
2.敏感性高,結(jié)果重復(fù)性好: GeXP系統(tǒng)克服了傳統(tǒng)PCR擴(kuò)增方法的不均等擴(kuò)增造成的偏差,提高了對(duì)一套目的基因進(jìn)行定量的速度和敏感性。
3.方法簡(jiǎn)便,使用經(jīng)濟(jì):GeXP提供從試劑、多重PCR引物設(shè)計(jì)、結(jié)果及定量表達(dá)譜分析等全套實(shí)驗(yàn)方案;GeXP內(nèi)在的多重分析能力可以使您在每個(gè)樣本花費(fèi)極低的前提下,同時(shí)分析多達(dá)30個(gè)的基因。
4.易于實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化:就樣品制備而言,Biomek系列自動(dòng)液體處理儀可以與GeXP分析儀和Ampligrid擴(kuò)增儀完全匹配, 集成的條形碼閱讀器保證了準(zhǔn)確的樣品追蹤和結(jié)果報(bào)告。
GeXP系統(tǒng)是基因表達(dá)多重定量分析的準(zhǔn)確、經(jīng)濟(jì)、高通量的最新解決方案,它能夠?qū)Χ嘀?/span>35重的目標(biāo)基因的表達(dá)情況進(jìn)行定量分析比較,是多重PCR領(lǐng)域的革命性技術(shù)。它巧妙的將多重PCR技術(shù)和毛細(xì)管電泳技術(shù)結(jié)合起來(lái),采用通用引物與特異引物相結(jié)合的方法,通過(guò)專(zhuān)利技術(shù)來(lái)實(shí)現(xiàn)多重PCR產(chǎn)物定量檢測(cè)的目的。GeXP系統(tǒng)克服了芯片成本高、重復(fù)性差和定量PCR方法通量低等弊端,是目前唯一可以進(jìn)行低成本高效的多重PCR定量分析的技術(shù)平臺(tái)。
二、主要應(yīng)用領(lǐng)域
(一) 臨床相關(guān)應(yīng)用
1.肝癌單細(xì)胞診斷與用藥指導(dǎo)
結(jié)合高端分選型流式細(xì)胞儀Moflo,我們可以根據(jù)所拿到的血清腫瘤循環(huán)細(xì)胞進(jìn)行單細(xì)胞PCR擴(kuò)增后,運(yùn)用GeXP技術(shù)對(duì)腫瘤細(xì)胞進(jìn)行遺傳學(xué)分析,充分解析其表達(dá)及基因突變點(diǎn),為臨床用藥指導(dǎo)提供幫助。鑒定癌良性腫瘤中有無(wú)惡變及其程度是實(shí)現(xiàn)正確有效干預(yù)的重要前提。
2.肝癌表達(dá)譜分析(腫瘤標(biāo)志物篩查)
3.乙肝病毒耐藥突變檢測(cè)
GeXP 在乙肝耐藥性檢測(cè)上,相比ABI 所有型號(hào)機(jī)器都有優(yōu)勢(shì):雜合子檢測(cè)能力(GeXP 可以檢測(cè)10%的雜合位點(diǎn)):乙肝患者服用藥物后,體內(nèi)病毒的突變是緩慢,循序漸進(jìn)的,因此在每次檢測(cè)時(shí)候,某段序列不可能100%全部突變成另外一段序列。如果能夠在病毒只有10%的耐藥性突變時(shí),調(diào)整給藥,將有利于及時(shí)控制病情。
4.以DNA序列分析為基礎(chǔ)的應(yīng)用
如病原體鑒定、突變分析、耐藥變異分析等。
5.以DNA片段分析為基礎(chǔ)的研究
SNP單堿基突變檢測(cè)、STR個(gè)體識(shí)別親緣鑒定、腫瘤細(xì)胞雜合子缺失分析、擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析、中藥指紋圖譜等。
(二)科研相關(guān)應(yīng)用
1.單細(xì)胞測(cè)序
采用AmpliGrid技術(shù),單細(xì)胞擴(kuò)增和測(cè)序可以整合在同一個(gè)工作流程中。PCR反應(yīng)在單細(xì)胞被放置的位點(diǎn)進(jìn)行,極大降低了污染的風(fēng)險(xiǎn)和測(cè)序噪音的產(chǎn)生。
2.單細(xì)胞基因表達(dá)
單個(gè)細(xì)胞的多重基因表達(dá)能為研究者提供豐富的基因表達(dá)信息, 在僅有一個(gè)獨(dú)特細(xì)胞的情況下,通過(guò)與Beckman CoulterGeXP多重基因表達(dá)系統(tǒng)的聯(lián)用,能為研究者提供關(guān)于一個(gè)細(xì)胞的40個(gè)基因表達(dá)信息。
3.單細(xì)胞拷貝數(shù)變異分析
AmpliGrid技術(shù)可以顯著地降低全基因組染色體缺失/存在分析的復(fù)雜度,用該方法檢測(cè)單細(xì)胞,結(jié)合對(duì)多個(gè)遺傳位點(diǎn)的冗余分析,使得染色體缺失/存在檢測(cè)更加準(zhǔn)確。
4.整合免疫分型和單細(xì)胞基因表達(dá)分析
除了上述研究的功能之外,GeXP既然被稱(chēng)為“多功能基因分析系統(tǒng)”它自然囊括了目前幾乎各種基因分析的應(yīng)用:
DNA的序列測(cè)定:可以實(shí)現(xiàn)800bpDNA的準(zhǔn)確測(cè)序,精確度高達(dá)98.5%
SNP多態(tài)性分析:可進(jìn)行多至10重的SNP位點(diǎn)分型
STR多態(tài)性分析:可以進(jìn)行人類(lèi)STR位點(diǎn)的分析,即個(gè)體識(shí)別
AFLP多態(tài)性分析
HLA精細(xì)分型
基于STR分析的連鎖分析
基于測(cè)序和片段分析的病毒基因型鑒定和載量分析
基因靶點(diǎn)Biomarker的發(fā)現(xiàn)
與癌癥等疾病發(fā)生有關(guān)的geneset 確證
RNA干擾(RNA interference)研究
代謝途徑分析(PathwayAnalysis)
基因表達(dá)調(diào)控的監(jiān)測(cè)(MonitorGene Regulation)
藥物特征研究(DrugCharacterization)
下一篇: 流式細(xì)胞儀